北约和欧盟的职能和活动范围产生重叠，虽然两个机构的成员国大范围重叠，但也有少数成员国不是北约或不是欧盟成员，这些国家担心受到北约或者欧盟歧视，特别是美国担心欧盟在防务问题上另起炉灶，削弱北约，所以两大机构的协调不可避免。在“9·11”事件的冲击下，2002年，欧盟与北约两大机构开始启动正式对话与合作。