郑丽文与民进党主流路线逐渐产生分歧，尤其对陈水扁当局的施政理念提出质疑，多次在媒体上批评民进党，并辞去民进党青年部副主任职务。2002年，因在涂醒哲“舔耳”事件相关节目中发表负面评论，与民进党立场冲突，最终以“民进党偏离初始理想”为由退出该党。此后，郑丽文的政治立场逐步转向泛蓝阵营，2004年台湾地区领导人选举后，她在泛蓝阵营抗议集会上担任主持，被视为正式“挺蓝”；2005年，在时任国民党主席连战邀请下，郑丽文正式加入中国国民党，先后担任国民党文化传播委员会副主任委员、发言人、主任委员等职，凭借过往选务经验与主持能力，在地方选举中助力国民党拉抬选情，成为党内重要的文宣骨干。